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Title: Vigilancia continua de variantes de SARS-CoV-2 en la Región Sanitaria VIII de la Provincia de Buenos Aires. Actualización 28/09/2023
Authors: Instituto Nacional de Epidemiología Dr. Juan H. Jara (INE) 
Keywords: COVID-19
Issue Date: Sep-2023
Publisher: ANLIS Dr.C.G.Malbrán
Abstract: 
Se lleva adelante la vigilancia de variantes de SARS-CoV-2 en el Laboratorio de Diagnóstico y Referencia del Instituto Nacional de Epidemiología, Juan Héctor Jara-ANLIS, mediante secuenciación de genomas completos de SARS-CoV-2 por secuenciación de nueva generación (NGS).
● Se obtuvieron 20 genomas completos, correspondientes a casos ARN positivos para SARSCoV-2 con Ct < 30 analizados en el período enero a setiembre 2023.
● Se detectó VOC Ómicron en el 100% de los casos.
● Los principales linajes/sub-linajes de Variante de Preocupación (VOC) Ómicron obtenidos fueron: BA.1.1 (5%); BQ.1.1 (5%); BQ.1.1.4 (14%); BQ.1.1.76 (5%); CH.1.1.3 (5%); EG.11 (5%); FE.1.1 (5%); FL.3 (5%); XBB.1.18.1 (5%); XBB.1.5.10 (14%); XBB.1.5.56 (5%).
● En la Región Sanitaria VIII de la Provincia de Buenos Aires, en el marco de la vigilancia activa de variantes se han analizado un total 782 muestras sospechosas de COVID-19 en el periodo de enero- setiembre 2023, 70 fueron Detectables para SARS-CoV-2 (8.9 %) y 20 muestras secuenciadas por Genoma completo (28.57.8% de las muestras confirmadas como SARS-CoV-2 detectable, 2.55 % de las muestras con cuadro respiratorio) y se les asignó la variante por el algoritmo NEXTCLADE.
URI: http://sgc.anlis.gob.ar/handle/123456789/2595
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