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Title: Performance of a commercial assay for the diagnosis of influenza A (H1N1) infection in comparison to the Centers for Disease Control and Prevention protocol of real time RT-PCR
Other Titles: Evaluación del desempeño de un equipo comercial para el diagnóstico de influenza A (H1N1) en comparación con el protocolo de RT-PCR en tiempo real diseñado por los Centros de Control y Prevención de Enfermedades (CDC)
Authors: Barbas, M. G. 
Gallego, S. V. 
Castro, G. M. 
Baumeister, Elsa 
Kademian, S. 
de Leon, J. 
Cudola, A. 
Keywords: Reacción en Cadena de la Polimerasa;Subtipo H1N1 del Virus de la Influenza A;Diagnóstico
Issue Date: 2012
Description: At the time of influenza A (H1N1) emergency, the WHO responded with remarkable speed by releasing guidelines and a protocol for a real-time RT-PCR assay (rRT-PCR). The aim of the present study was to evaluate the performance of the “Real Time Ready Influenza A/H1N1 Detection Set” (June 2009)-Roche kit in comparison to the CDC reference rRT-PCR protocol. The overall sensitivity of the Roche assay for detection of the Inf A gene in the presence or absence of the H1 gene was 74.5 %. The sensitivity for detecting samples that were only positive for the Inf A gene (absence of the H1 gene) was 53.3 % whereas the sensitivity for H1N1-positive samples (presence of the Inf A gene and any other swine gene) was 76.4 %. The specificity of the assay was 97.1 %. A new version of the kit (November 2009) is now available, and a recent evaluation of its performance showed good sensitivity to detect pandemic H1N1 compared to other molecular assays.
Durante la pandemia de influenza A (H1N1), la OMS recomendó algoritmos y protocolos de detección del virus mediante RT-PCR en tiempo real. El objetivo del presente estudio fue evaluar el desempeño del equipo que comercializa la empresa Roche, Real Time Ready Influenza A/H1N1 Detection Set (junio de 2009), en comparación con el protocolo de RT-PCR en tiempo real de los CDC. La sensibilidad global del ensayo de Roche para la detección del gen Inf A en presencia o ausencia del gen H1 fue 74,5 %. La sensibilidad para la detección de muestras positivas solo para el gen Inf A (ausencia del gen H1) fue 53,3 % y la sensibilidad para la detección de muestras positivas para H1N1 (presencia del gen Inf A y cualquier otro gen porcino) fue 76,4 %. La especificidad fue 97,1 %. Existe una nueva versión del equipo (noviembre 2009) que, según se ha descrito, presenta buena sensibilidad en comparación con otros ensayos moleculares para detectar H1N1 pandémica.
Fil: Barbas, M. G. Laboratorio Central del Ministerio de Salud de la Provincia de Córdoba; Argentina.
Fil: Gallego, S. V. Laboratorio Central del Ministerio de Salud de la Provincia de Córdoba; Argentina.
Fil: Castro, G. M. Laboratorio Central del Ministerio de Salud de la Provincia de Córdoba; Argentina.
Fil: Baumeister, E. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas; Argentina.
Fil: Kademian, S. Laboratorio Central del Ministerio de Salud de la Provincia de Córdoba; Argentina.
Fil: de Leon, J. Laboratorio Central del Ministerio de Salud de la Provincia de Córdoba; Argentina.
Fil: Cudola, A. Laboratorio Central del Ministerio de Salud de la Provincia de Córdoba; Argentina.
URI: http://www.scielo.org.ar/pdf/ram/v44n1/v44n1a06.pdf
http://sgc.anlis.gob.ar/handle/123456789/105
ISSN: 0325-7541
Rights: info:eu-repo/semantics/openAccess
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