Antecedentes: Durante un período de 4 meses, y mientras se llevaba a cabo un muestreo ambiental de aire, se diagnosticaron 2 casos de aspergilosis por Aspergillus flavus en un centro oncohematológico de Buenos Aires, Argentina. Objetivos: Conocer la variabilidad y la relación genética entre los aislamientos clínicos y los ambientales obtenidos en el centro oncohematológico. Métodos: Se utilizaron 2 técnicas de genotipificación con diferente poder discriminatorio (RAPD y AFLP). Una matriz de similitud genética fue calculada usando el método de Jaccard y fue la base para la cons- trucción de un dendrograma por el método de UPGMA. Se estimó el nivel de variabilidad genética por medio del porcentaje de loci polimórficos, número de alelos efectivos y heterocigosidad esperada, y el índice de asociación (I A ) . Resultados: El dendrograma mostró que los aislamientos de A. flavus recuperados de los pacientes no se relacionaron genéticamente con los del ambiente nosocomial. Los valores más altos de diversidad gené- tica correspondieron a los aislamientos ambientales. El I A estimado para todos los aislamientos sugiere eventos de recombinación. Conclusiones: Los pacientes 1 y 2 no fueron infectados con los aislamientos obtenidos del ambiente hospitalario. Los aislamientos clínicos y ambientales de A. flavus mostraron alta variabilidad genética entre ellos.