Protocolo de Análisis de Secuencias Genómicas de Listeria monocytogenes

Abstract

Listeria monocytogenes es el agente causal de la listeriosis, una de las enfermedades de transmisión alimentaria más graves que afecta a humanos, con una mortalidad estimada de 20 a 30%. Esta infección suele aparecer en forma de casos esporádicos y en pequeños brotes. La vigilancia epidemiológica de los casos humanos y matrices alimentarias resulta fundamental para la identificación de asociaciones y sitios comunes de infección. La secuenciación del genoma completo de los micoorganismos patógenos es una herramienta importante que proporciona información genética que mejora la capacidad de los sistemas de vigilancia para detectar, investigar y detener brotes transmitidos por alimentos. Este documento aborda el procedimiento de análisis de la información genómica de para L. monocytogenes y está basado en un algoritmo que utiliza línea de comando (UNIX).