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http://sgc.anlis.gob.ar/handle/123456789/2535
DC Field | Value | Language |
---|---|---|
dc.contributor.author | Sanz, María Belén | es |
dc.contributor.author | De Belder, Denise | es |
dc.contributor.author | de Mendieta, J M | es |
dc.contributor.author | Faccone, Diego | es |
dc.contributor.author | Poklépovich, Tomás Javier | es |
dc.contributor.author | Lucero, María Celeste | es |
dc.contributor.author | Rapoport, Melina J. | es |
dc.contributor.author | Campos, Josefina | es |
dc.contributor.author | Tuduri, Ezequiel | es |
dc.contributor.author | Saavedra, Mathew O | es |
dc.contributor.author | van der Ploeg, Claudia Andrea | es |
dc.contributor.author | Rogé, Ariel Diego | es |
dc.contributor.author | Pasteran, Fernando | es |
dc.contributor.author | Corso, Alejandra | es |
dc.contributor.author | Rosato, Adriana E | es |
dc.contributor.author | Gómez, Sonia Alejandra | es |
dc.date.accessioned | 2023-03-08T17:10:53Z | - |
dc.date.available | 2023-03-08T17:10:53Z | - |
dc.date.issued | 2022 | - |
dc.identifier.issn | 1664-302X | - |
dc.identifier.uri | http://sgc.anlis.gob.ar/handle/123456789/2535 | - |
dc.description | Fil: Sanz, María Belén. Servicio Antimicrobianos, Laboratorio Nacional de Referencia en Resistencia a los Antimicrobianos (LNRRA), INEI-ANLIS "Dr. Carlos G. Malbrán"; Buenos Aires, Argentina | es |
dc.description | Fil: De Belder, Denise. Plataforma Genómica y Bioinformática (PLABIO), INEI-ANLIS "Dr. Carlos G. Malbrán"; Buenos Aires, Argentina | es |
dc.description | Fil: De Mendieta, J M. Servicio Antimicrobianos, Laboratorio Nacional de Referencia en Resistencia a los Antimicrobianos (LNRRA), INEI-ANLIS "Dr. Carlos G. Malbrán"; Buenos Aires, Argentina | es |
dc.description | Fil: Faccone, Diego. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET); Buenos Aires, Argentina | es |
dc.description | Fil: Poklepovich, Tomás. Plataforma Genómica y Bioinformática (PLABIO), INEI-ANLIS "Dr. Carlos G. Malbrán"; Buenos Aires, Argentina | es |
dc.description | Fil: Lucero, Celeste. Servicio Antimicrobianos, Laboratorio Nacional de Referencia en Resistencia a los Antimicrobianos (LNRRA), INEI-ANLIS "Dr. Carlos G. Malbrán"; Buenos Aires, Argentina | es |
dc.description | Fil: Rapoport, Melina. Servicio Antimicrobianos, Laboratorio Nacional de Referencia en Resistencia a los Antimicrobianos (LNRRA), INEI-ANLIS "Dr. Carlos G. Malbrán"; Buenos Aires, Argentina | es |
dc.description | Fil: Campos, Josefina. Plataforma Genómica y Bioinformática (PLABIO), INEI-ANLIS "Dr. Carlos G. Malbrán"; Buenos Aires, Argentina | es |
dc.description | Fil: Tuduri, Ezequiel. Servicio Antimicrobianos, Laboratorio Nacional de Referencia en Resistencia a los Antimicrobianos (LNRRA), INEI-ANLIS "Dr. Carlos G. Malbrán"; Buenos Aires, Argentina | es |
dc.description | Fil: Saavedra, Mathew O. Department of Pathology and Genomic Medicine, Center for Molecular and Translational Human Infectious Diseases Research, Houston Methodist Hospital, Houston Methodist Research Institute; United States | es |
dc.description | Fil: Van der Ploeg, Claudia. Servicio de Antígenos y Antisueros, INPB-ANLIS "Dr. Carlos G. Malbrán"; Buenos Aires, Argentina | es |
dc.description | Fil: Rogé, Ariel. Servicio de Antígenos y Antisueros, INPB-ANLIS "Dr. Carlos G. Malbrán"; Buenos Aires, Argentina | es |
dc.description | Fil: Pasteran, Fernando. Servicio Antimicrobianos, Laboratorio Nacional de Referencia en Resistencia a los Antimicrobianos (LNRRA), INEI-ANLIS "Dr. Carlos G. Malbrán"; Buenos Aires, Argentina | es |
dc.description | Fil: Corso, Alejandra. Servicio Antimicrobianos, Laboratorio Nacional de Referencia en Resistencia a los Antimicrobianos (LNRRA), INEI-ANLIS "Dr. Carlos G. Malbrán"; Buenos Aires, Argentina | es |
dc.description | Fil: Rosato, Adriana E. Department of Pathology and Molecular Microbiology Diagnostics-Research, Riverside University Health System; United States | es |
dc.description | Fil: Gomez, Sonia A. Servicio Antimicrobianos, Laboratorio Nacional de Referencia en Resistencia a los Antimicrobianos (LNRRA), INEI-ANLIS "Dr. Carlos G. Malbrán"; Buenos Aires, Argentina | es |
dc.description.abstract | Extraintestinal pathogenic Escherichia coli (ExPEC) causes infections outside the intestine. Particular ExPEC clones, such as clonal complex (CC)/sequence type (ST)131, have been known to sequentially accumulate antimicrobial resistance that starts with chromosomal mutations against fluoroquinolones, followed with the acquisition of bla CTX-M-15 and, more recently, carbapenemases. Here we aimed to investigate the distribution of global epidemic clones of carbapenemase-producing ExPEC from Argentina in representative clinical isolates recovered between July 2008 and March 2017. Carbapenemase-producing ExPEC (n = 160) were referred to the Argentinean reference laboratory. Of these, 71 were selected for genome sequencing. Phenotypic and microbiological studies confirmed the presence of carbapenemases confirmed as KPC-2 (n = 52), NDM-1 (n = 16), IMP-8 (n = 2), and VIM-1 (n = 1) producers. The isolates had been recovered mainly from urine, blood, and abdominal fluids among others, and some were from screening samples. After analyzing the virulence gene content, 76% of the isolates were considered ExPEC, although non-ExPEC isolates were also obtained from extraintestinal sites. Pan-genome phylogeny and clonal analysis showed great clonal diversity, although the first phylogroup in abundance was phylogroup A, harboring CC10 isolates, followed by phylogroup B2 with CC/ST131, mostly H30Rx, the subclone co-producing CTX-M-15. Phylogroups D, B1, C, F, and E were also detected with fewer strains. CC10 and CC/ST131 were found throughout the country. In addition, CC10 nucleated most metalloenzymes, such as NDM-1. Other relevant international clones were identified, such as CC/ST38, CC155, CC14/ST1193, and CC23. Two isolates co-produced KPC-2 and OXA-163 or OXA-439, a point mutation variant of OXA-163, and three isolates co-produced MCR-1 among other resistance genes. To conclude, in this work, we described the molecular epidemiology of carbapenemase-producing ExPEC in Argentina. Further studies are necessary to determine the plasmid families disseminating carbapenemases in ExPEC in this region. | es |
dc.language.iso | en | es |
dc.relation.ispartof | Frontiers in microbiology | es |
dc.relation.ispartofseries | Front Microbiol;18(13)2022:1-11 | - |
dc.subject | Escherichia coli | es |
dc.subject | Enterobacteriaceae Resistentes a los Carbapenémicos | es |
dc.subject | Células Clonales | es |
dc.subject | Filogenia | es |
dc.title | Carbapenemase-Producing Extraintestinal Pathogenic Escherichia coli From Argentina: Clonal Diversity and Predominance of Hyperepidemic Clones CC10 and CC131 | es |
dc.type | Artículo | es |
dc.identifier.doi | 10.3389/fmicb.2022.830209 | - |
item.openairecristype | http://purl.org/coar/resource_type/c_18cf | - |
item.cerifentitytype | Publications | - |
item.grantfulltext | open | - |
item.openairetype | Artículo | - |
item.fulltext | With Fulltext | - |
item.languageiso639-1 | en | - |
crisitem.author.dept | Servicio Antimicrobianos | - |
crisitem.author.dept | Departamento de Bacteriología | - |
crisitem.author.dept | Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas (INEI) | - |
crisitem.author.dept | Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud “Dr. Carlos G. Malbrán” (ANLIS) | - |
crisitem.author.dept | Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud “Dr. Carlos G. Malbrán” (ANLIS) | - |
crisitem.author.dept | Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas (INEI) | - |
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crisitem.author.dept | Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud “Dr. Carlos G. Malbrán” (ANLIS) | - |
crisitem.author.dept | Instituto Nacional de Producción de Biológicos (INPB) | - |
crisitem.author.dept | Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud “Dr. Carlos G. Malbrán” (ANLIS) | - |
crisitem.author.dept | Maestría en Microbiología Molecular UNSM-ANLIS | - |
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crisitem.author.orcid | https://orcid.org/0000-0003-1409-0441 | - |
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