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Title: Informe del estudio de comparación del uso de hisopado nasofaríngeo-orofaríngeo combinado versus saliva para la detección de genoma de SARSCoV-2 en casos sospechosos de COVID-19
Authors: Baumeister, Elsa 
Keywords: Infecciones por Coronavirus;COVID19;Informe de Investigación
Issue Date: 23-May-2020
Publisher: ANLIS Dr.C.G.Malbrán
Abstract: Debido a la pandemia en curso, a la escasez de insumos para realizar los ensayos diagnósticos y la necesidad de llevar a cabo testeos masivos para establecer de manera dinámica la prevalencia de individuos con capacidad de transmitir la infección se realizó la comparación del uso de la muestra clínica de hisopado nasofaríngeo-orofaríngeo combinado (HNF) con la muestra de saliva (S). Se estudiaron 284 muestras de HNF y las 284 muestras pareadas correspondientes de S para la detección de SARSCoV-2 en pacientes sospechosos de COVID-19. Los resultados obtenidos indican que la sensibilidad de la detección de genoma de SARSCoV-2 en S no supera el 90 % pero la especificidad es aceptable, de la misma manera que el VPP, resultados similares a los comunicados por otros grupos de trabajo. Si bien la concordancia del rendimiento de ambas muestras es buena, índice Kappa 0.746, el VPN resultó ser 68.9%, lo que indica que el 30% de los resultados negativos podrían no ser verdaderos negativos. En relación a la positividad en función del tiempo, no se observaron diferencias, pero es destacable que se pudo detectar genoma viral en S con período de evolución prolongado, este hallazgo necesita de la verificación con un mayor número de muestras en esas condiciones. Las pruebas de diagnóstico para COVID-19 son fundamentales para controlar la pandemia global. Recientemente se ha informado que pacientes que tenían SARS-CoV-2 detectado por RTPCRrt en HNF o esputo también tenía SARS-CoV-2 detectable en saliva. El uso de S tiene varias ventajas en comparación con la recolección de HNF. En particular, el contacto cercano involucrado en la toma del HNF que representa un riesgo para los trabajadores de la salud mientras que la recolección S puede reducir este riesgo además no requiere el uso de hisopos y demás consumibles, causa menos molestias al paciente y puede ser una muestra útil para la auto-recolección manteniendo pautas de bioseguridad apropiadas. La sensibilidad y el VPN de la S como muestra diagnóstica son menores que para el HNF aunque en entornos de bajos recursos, de escasez de insumos diagnósticos o muestreos de screening masivos puede constituirse en una alternativa sin dejar de considerar la pérdida de información que podría generarse.
Description: Fil: Baumeister, E. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Servicio de Virosis Respiratoria; Argentina
URI: http://sgc.anlis.gob.ar/handle/123456789/1594
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