Please use this identifier to cite or link to this item:
http://sgc.anlis.gob.ar/handle/123456789/2389
DC Field | Value | Language |
---|---|---|
dc.contributor.author | Wehrendt, Diana P | es |
dc.contributor.author | Massó, Mariana G | es |
dc.contributor.author | Gonzales Machuca, Adrián | es |
dc.contributor.author | Vargas, Claudia V | es |
dc.contributor.author | Barrios, Melina E | es |
dc.contributor.author | Campos, Josefina | es |
dc.contributor.author | Costamagna, Damián | es |
dc.contributor.author | Bruzzone, Luis | es |
dc.contributor.author | Cisterna, Daniel | es |
dc.contributor.author | Iglesias, Néstor Gabriel | es |
dc.contributor.author | Mbayed, Viviana A | es |
dc.contributor.author | Baumeister, Elsa | es |
dc.contributor.author | Centrón, Daniela | es |
dc.contributor.author | Quiroga, María Paula | es |
dc.contributor.author | Erijman, Leonardo | es |
dc.date.accessioned | 2021-11-03T22:57:28Z | - |
dc.date.available | 2021-11-03T22:57:28Z | - |
dc.date.issued | 2021 | - |
dc.identifier.uri | http://sgc.anlis.gob.ar/handle/123456789/2389 | - |
dc.description | Fil. Wehrendt, Diana P. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular "Dr Héctor N. Torres" (INGEBI) Vuelta de Obligado 2490, C1428ADN, Buenos Aires, Argentina; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Argentina. | es |
dc.description | Fil. Massó, Mariana G. Laboratorio de Investigaciones en Mecanismos de Resistencia a Antibióticos. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica, Facultad de Medicina, Universidad de Buenos Aires (IMPaM, UBA-CONICET), Argentina. | es |
dc.description | Fil. Gonzales Machuca, Adrián. Laboratorio de Investigaciones en Mecanismos de Resistencia a Antibióticos. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica, Facultad de Medicina, Universidad de Buenos Aires (IMPaM, UBA-CONICET), Argentina. | es |
dc.description | Fil. Vargas, Claudia V. Instituto de Investigaciones en Producción Animal (INPA), Argentina. | es |
dc.description | Fil. Barrios, Melina E. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Argentina; Universidad de Buenos Aires, Facultad de Farmacia y Bioquímica, Argentina. | es |
dc.description | Fil. Campos, Josefina. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas; Argentina. | es |
dc.description | Fil. Costamagna, Damián. Autoridad del Agua, Gobierno de la Provincia de Buenos Aires, Argentina. | es |
dc.description | Fil. Bruzzone, Luis. Aguas Bonaerenses SA, Argentina. | es |
dc.description | Fil. Cisterna, Daniel M. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas; Argentina. | es |
dc.description | Fil. Iglesias, Néstor Gabriel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Argentina; Laboratorio de Virus Emergentes, Departamento de Ciencia y Tecnología, Universidad Nacional de Quilmes, Argentina. | es |
dc.description | Fil. Mbayed, Viviana A.Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Argentina; Universidad de Buenos Aires, Facultad de Farmacia y Bioquímica, Argentina; Instituto de Investigaciones en Bacteriología y Virologia Molecular (IBAViM), Argentina. | es |
dc.description | Fil. Baumeister, Elsa. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Virología. Servicio de Virosis Respiratoria; Argentina. | es |
dc.description | Fil. Centrón, Daniela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Argentina; Laboratorio de Investigaciones en Mecanismos de Resistencia a Antibióticos. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica, Facultad de Medicina, Universidad de Buenos Aires (IMPaM, UBA-CONICET), Argentina. | es |
dc.description | Fil. Quiroga, María Paula. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Argentina; Laboratorio de Investigaciones en Mecanismos de Resistencia a Antibióticos. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica, Facultad de Medicina, Universidad de Buenos Aires (IMPaM, UBA-CONICET), Argentina. | es |
dc.description | Fil. Erijman, Leonardo. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular "Dr Héctor N. Torres" (INGEBI) Vuelta de Obligado 2490, C1428ADN, Buenos Aires, Argentina; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Argentina; Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires, Argentina. | es |
dc.description.abstract | The aim of this study was to set up a simple protocol to concentrate SARS-CoV-2 from sewage, which can be implemented in laboratories with minimal equipment resources. The method avoids the need for extensive purification steps and reduces the concentration of potential inhibitors of RT-qPCR contained in sewage. The concentration method consists of a single step, in which a small volume (40 mL) of sewage sample is incubated with polyaluminum chloride (PAC)(0.00045 N Al3+ final concentration). Virus particles adsorbed to the precipitate are collected by low-speed centrifugation, after which the recovered pellet is resuspended with a saline buffer. PAC-concentrated samples are stable for at least one week at 4 °C. Therefore, they may be sent refrigerated to a diagnosis center for RNA extraction and RT-qPCR for SARS-CoV-2 RNA detection if the lab does not have such capabilities. The PAC concentration method produced an average shift of 4.5-units in quantification cycle (Cq) values compared to non-concentrated samples, indicating a 25-fold increase in detection sensitivity. The lower detection limit corresponded approximately to 100 viral copies per ml. Kappa index indicated substantial agreement between PAC and polyethylene glycol (PEG) precipitation protocols (k = 0.688, CI 0.457-0.919). This low-cost concentration protocol could be useful to aid in the monitoring of community circulation of SARS-CoV-2, especially in low- and middle-income countries, which do not have massive access to support from specialized labs for sewage surveillance. | es |
dc.language.iso | en | es |
dc.relation.ispartof | Journal of virological methods | es |
dc.subject | Monitoreo Epidemiológico Basado en Aguas Residuales | es |
dc.subject | Acciones Tóxicas | es |
dc.subject | COVID-19 | es |
dc.subject | Aguas del Alcantarillado | es |
dc.subject | Pruebas de Sensibilidad Microbiana | es |
dc.title | A rapid and simple protocol for concentration of SARS-CoV-2 from sewage | es |
dc.type | Artículo | es |
dc.identifier.doi | 10.1016/j.jviromet.2021.114272 | - |
item.openairecristype | http://purl.org/coar/resource_type/c_18cf | - |
item.cerifentitytype | Publications | - |
item.grantfulltext | open | - |
item.openairetype | Artículo | - |
item.fulltext | With Fulltext | - |
item.languageiso639-1 | en | - |
crisitem.author.dept | Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud “Dr. Carlos G. Malbrán” (ANLIS) | - |
crisitem.author.dept | Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas (INEI) | - |
crisitem.author.dept | Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud “Dr. Carlos G. Malbrán” (ANLIS) | - |
crisitem.author.dept | Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas (INEI) | - |
crisitem.author.dept | Departamento de Virología | - |
crisitem.author.dept | Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud “Dr. Carlos G. Malbrán” (ANLIS) | - |
crisitem.author.dept | Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas (INEI) | - |
crisitem.author.dept | Departamento de Virología | - |
crisitem.author.dept | Servicio de Virosis Respiratoria | - |
crisitem.author.orcid | https://orcid.org/0000-0003-1409-0441 | - |
crisitem.author.parentorg | Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud “Dr. Carlos G. Malbrán” (ANLIS) | - |
crisitem.author.parentorg | Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud “Dr. Carlos G. Malbrán” (ANLIS) | - |
crisitem.author.parentorg | Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas (INEI) | - |
crisitem.author.parentorg | Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud “Dr. Carlos G. Malbrán” (ANLIS) | - |
crisitem.author.parentorg | Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas (INEI) | - |
crisitem.author.parentorg | Departamento de Virología | - |
Appears in Collections: | Publicaciones INEI |
Files in This Item:
File | Description | Size | Format | |
---|---|---|---|---|
1-s2.0-S0166093421002111-main inei 3 3-11.pdf | Artículo en inglés | 1.1 MB | Adobe PDF | View/Open |
Page view(s)
93
checked on May 4, 2024
Download(s)
11
checked on May 4, 2024
Google ScholarTM
Check
Altmetric
Altmetric
Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.