http://sgc.anlis.gob.ar/handle/123456789/1593 2026-04-21T22:18:52Z http://sgc.anlis.gob.ar/handle/123456789/2618 Title: Informe técnico sobre la tuberculosis multidrogorresistente en la Argentina, 2023 Authors: Yokobori, Noemi; Paul, Roxana Abstract: [RESUMEN]: La tuberculosis multidrogorresistente (TB-MR) representa un gran desafío sanitario debido a su mayor costo económico y social para el sistema de salud, así como para las comunidades a las que afecta. En Argentina, la TB-MR ha estado históricamente asociada a brotes generados por ciertos clones epidémicos bien caracterizados como las cepas M, Ra, Rb, entre otros. Estos genotipos estuvieron asociados a poblaciones vulnerables conocidas y nichos geográficos definidos. En la última década, y particularmente luego de la pandemia debida al SARS-CoV2, el panorama epidemiológico de la TB-MR ha sufrido algunos cambios notorios. Si bien la TB-MR continúa siendo mayormente debida a la transmisión de clones que adquirieron resistencias en el pasado, los genotipos principales han variado. A su vez, algunos de los nichos sociales y geográficos asociados a la TB-MR han cambiado. Se ha reducido la circulación de la cepa M, responsable del mayor brote de TB-MR de Latinoamérica, mientras que la cepa Callao2, tradicionalmente asociada a casos importados, ha comenzado su transmisión comunitaria a nivel local. Además, la migración interna ha llevado a una dispersión de la cepa Rb en el territorio nacional. También se han registrado brotes recientes de importancia local debidos a genotipos minoritarios que han persistido en bajo número por décadas como la cepa Fv del partido de Florencio Varela, provincia de Buenos Aires o la cepa Ch de Resistencia, Chaco. Por otro lado, las personas nacidas en Bolivia que residen en el AMBA surgen como un nuevo grupo de riesgo para la TB-MR. En paralelo a estos cambios, hubo mejoras tecnológicas en el diagnóstico de la TB-MR como la incorporación de métodos moleculares automatizados para el diagnóstico a nivel periférico y de la secuenciación de genoma completo a nivel referencial, que a su vez plantean nuevos desafíos. En esta actualización sobre la vigilancia de la TB-MR en Argentina se presentan el panorama epidemiológico reciente, las mutaciones que confieren resistencia a las principales drogas y la situación de la TB pre-XDR y XDR en Argentina en el periodo 2012-2022. Description: Fil: Noemi Yokobori. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET). Ciudad Autónoma de Buenos Aires; Argentina; Fil: Paul, Roxana. Servicio de Micobacterias. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud (ANLIS) “Dr. C. G. Malbrán”. Ciudad Autónoma de Buenos Aires; Argentina 2023-01-01T00:00:00Z http://sgc.anlis.gob.ar/handle/123456789/2611 Title: Vigilancia genómica de Streptococcus pyogenes en enfermedad invasiva en Argentina. INFORME 2023 Authors: Cipolla, Lucía; Gianecini, Ricardo Ariel; Prieto, Mónica A. Abstract: Durante la temporada 2015-2016, el Reino Unido informó un notable aumento en los casos de escarlatina y de infecciones invasivas por Streptococcus pyogenes. Ambas presentaciones clínicas estaban asociadas con la aparición del clon M1UK y que corresponde a un nuevo linaje de la cepa pandémica M1T1 (M1global) que produce más exotoxina superantigénica SpeA. La rápida diseminación de esta nueva línea clonal de S. pyogenes contribuyó a aumentos estacionales de fiebre escarlatina y un marcado incremento en infecciones invasivas en varios países. La vigilancia de la dinámica poblacional de S. pyogenes requiere la secuenciación del genoma completo (SGC). En el año 2022, el Laboratorio Nacional de Referencia, Servicio Bacteriología Especial del Departamento de Bacteriología, INEI-ANLIS incorporó la SGC para la vigilancia de S. pyogenes de casos invasivos. Durante el año 2023, fueron notificados en el SNVS 926 casos de enfermedad invasiva por S. pyogenes (iGAS), de los cuales 505 aislamientos fueron derivados al LNR para estudios genómicos. La secuenciación del genoma y los análisis bioinformáticos fueron completados para el 96% de los aislados 1. La vigilancia de los iGAS mediante análisis genómicos incluye la subtipificación mediante el esquema de emm-typing y la determinación del secuenciotipo (ST) a través del análisis de MLST. Estos métodos de subtipificación son herramientas clave para identificar los iGAS circulantes. Una vez que se han identificado los tipos emm, es necesario llevar a cabo un análisis más detallado para conocer las variantes o linajes dentro de un mismo tipo emm (linajes intra-M). Estos linajes pueden surgir a través de la aparición de mutaciones puntuales en el genoma y/o la adquisición de nuevos genes de virulencia y/o resistencia, lo que puede dar origen a variantes más virulentas. El 74 % de los aislamientos fueron derivados por participantes de la Red Nacional de Infecciones Bacterianas del SNC, Respiratorias y Sistémicas. 2024-04-09T00:00:00Z http://sgc.anlis.gob.ar/handle/123456789/1594 Title: Informe del estudio de comparación del uso de hisopado nasofaríngeo-orofaríngeo combinado versus saliva para la detección de genoma de SARSCoV-2 en casos sospechosos de COVID-19 Authors: Baumeister, Elsa Abstract: Debido a la pandemia en curso, a la escasez de insumos para realizar los ensayos diagnósticos y la necesidad de llevar a cabo testeos masivos para establecer de manera dinámica la prevalencia de individuos con capacidad de transmitir la infección se realizó la comparación del uso de la muestra clínica de hisopado nasofaríngeo-orofaríngeo combinado (HNF) con la muestra de saliva (S). Se estudiaron 284 muestras de HNF y las 284 muestras pareadas correspondientes de S para la detección de SARSCoV-2 en pacientes sospechosos de COVID-19. Los resultados obtenidos indican que la sensibilidad de la detección de genoma de SARSCoV-2 en S no supera el 90 % pero la especificidad es aceptable, de la misma manera que el VPP, resultados similares a los comunicados por otros grupos de trabajo. Si bien la concordancia del rendimiento de ambas muestras es buena, índice Kappa 0.746, el VPN resultó ser 68.9%, lo que indica que el 30% de los resultados negativos podrían no ser verdaderos negativos. En relación a la positividad en función del tiempo, no se observaron diferencias, pero es destacable que se pudo detectar genoma viral en S con período de evolución prolongado, este hallazgo necesita de la verificación con un mayor número de muestras en esas condiciones. Las pruebas de diagnóstico para COVID-19 son fundamentales para controlar la pandemia global. Recientemente se ha informado que pacientes que tenían SARS-CoV-2 detectado por RTPCRrt en HNF o esputo también tenía SARS-CoV-2 detectable en saliva. El uso de S tiene varias ventajas en comparación con la recolección de HNF. En particular, el contacto cercano involucrado en la toma del HNF que representa un riesgo para los trabajadores de la salud mientras que la recolección S puede reducir este riesgo además no requiere el uso de hisopos y demás consumibles, causa menos molestias al paciente y puede ser una muestra útil para la auto-recolección manteniendo pautas de bioseguridad apropiadas. La sensibilidad y el VPN de la S como muestra diagnóstica son menores que para el HNF aunque en entornos de bajos recursos, de escasez de insumos diagnósticos o muestreos de screening masivos puede constituirse en una alternativa sin dejar de considerar la pérdida de información que podría generarse. Description: Fil: Baumeister, E. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Servicio de Virosis Respiratoria; Argentina 2020-05-23T00:00:00Z