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- Departamento de Investigación Epidemiológica 8
- Departamento de Investigación Epidemiológica 7
- Departamento de Investigación Epidemiológica (INE) 6
- Departamento de Micología 14
- Departamento de Parasitología 9
- Departamento de Producción (INEVH) 8
- Departamento de Programas de Salud 9
- Departamento de Vigilancia y Clínica Epidemiológica 8
- Departamento de Virología 11
- División Biotecnología (INEVH) 2
- División Control y Certificación de Calidad (INEVH) 4
- División de Producción de vacunas y biológicos, cultivos celulares, medios y reactivos (INEVH) 2
- División Diagnóstico de Laboratorio, Investigación y Bioseguridad (INEVH) 1
- División Diagnóstico, Fisiopatología, Tratamiento y Prevención (INEVH) 1
- División Epidemiología, Ecología y Bioestadística (INEVH) 1
- División Normas de Control y Certificación de Calidad (INEVH) 1
- División Virología e Inmunología (INEVH) 2
- Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas (INEI) 89
- Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias (INER) 24
- Instituto Nacional de Enfermedades Virales Humanas (INEVH) 28